Базовая кафедра «Системные исследования» на факультете управления и прикладной математики МФТИ. Создана в 2003 году. Зав. кафедрой чл.-корр. РАН Ю.С.Попков.
С 2013 г. кафедра является межфакультетской, обучение ведется по 2 специализациям:
- оценка эффективности инвестиционных проектов, зав. специализацией проф. Лившиц В.Н.
- системные исследования, зав. специализацией проф. Попков Ю.С.
C сентября 2006 г. в ИСА РАН cовместным приказом Ректора МГТУ им. Н.Э. Баумана и Директора ИСА РАН открыт филиал кафедры Математическое моделирование МГТУ им. Н.Э. Баумана. Руководство филиалом – чл.-корр. РАН Крищенко А.П.
Базовая кафедра "Интеллектуальные технологии системного анализа и управления" на факультете компьютерных наук НИУ ВШЭ. Кафедра создана в 2013 году. Зав. кафедрой: Посыпкин М.А., д.ф.-м.н.
Базовая кафедра "Информационные технологии в моделировании и управлении" в Московском авиационном институте - МАИ (национальный исследовательский университет). Создана в 2016 году. Зав. кафедрой - Абгарян К. К., д.ф.-м.н., доцент.
Кафедра готовит математиков, системных программистов по специальности 02.03.02 - Фундаментальная информатика и информационные технологии.
На базе кафедры регулярно проводится междисциплинарный научно-практический семинар по проблеме «Математическое моделирование в материаловедении электронных наноструктур».
Базовая Кафедра интеллектуальных систем на факультете управления и прикладной математики Московского Физико-Технического института – МФТИ (национальный исследовательский университет). Организована в 2003 году. Заведует кафедрой академик РАН, профессор Рудаков К. В. Заместитель заведующего кафедрой - д.ф.-м.н. Воронцов К. В.
- интеллектуальный анализ данных,
- проектирование и организация систем,
- информационный поиск и машинное обучение.
Базовая кафедра "Математическое моделирование сложных систем и оптимизация» в Московском Физико-Техническом Институте – МФТИ (национальный исследовательский университет). Зав. кафедрой - Поспелов И. Г., чл.-корр. РАН, профессор. Зам. зав. кафедрой - Жукова А. А. , к.ф.-м.н., с.н.с.
Базовая кафедра «Прикладные информационно-коммуникационные средства и системы» в МИЭМ НИУ ВШЭ. Зав. кафедрой: Щур Л.В., д.ф.-м.н., профессор.
